Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z40

Gbp7, Gbp6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp7Q91Z40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbp7Q91Z40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbp7Q91Z40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms