Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms