Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usb1Q91W78 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms