Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Farp2Q91VS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Farp2Q91VS8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Farp2Q91VS8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms