Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RestQ8VIG1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RestQ8VIG1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms