Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms