Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cabp4Q8VHC5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cabp4Q8VHC5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cabp4Q8VHC5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms