Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms