Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV8

Mitd1, MIT domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mitd1Q8VDV8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mitd1Q8VDV8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mitd1Q8VDV8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms