Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg2Q8VCK3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg2Q8VCK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms