Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn4Q8VCH8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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