Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd109Q8R422 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cd109Q8R422 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd109Q8R422 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms