Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms