Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo18Q8K2I9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms