Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Abcf3Q8K268 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Abcf3Q8K268 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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