Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt33aQ8K0Y2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms