Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FgbQ8K0E8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FgbQ8K0E8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FgbQ8K0E8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms