Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms