Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TwnkQ8CIW5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TwnkQ8CIW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms