Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mterf1aQ8CHZ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms