Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Hpf1Q8CFE2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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