Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pramef8Q8CE24 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef8Q8CE24 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms