Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc158Q8CDI6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc158Q8CDI6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms