Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Podxl2Q8CAE9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Podxl2Q8CAE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms