Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A930004D18RikQ8C8W7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A930004D18RikQ8C8W7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
A930004D18RikQ8C8W7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms