Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms