Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cwc22Q8C5N3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cwc22Q8C5N3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms