Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt3Q8BXF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms