Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skor1Q8BX46 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms