Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4aQ8BW72 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms