Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb1Q8BSK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms