Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt2aQ8BNV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt2aQ8BNV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms