Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe23Q8BGW3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms