Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vipas39Q8BGQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Vipas39Q8BGQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Vipas39Q8BGQ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Vipas39Q8BGQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Vipas39Q8BGQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Vipas39Q8BGQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vipas39Q8BGQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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