Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptlc3Q8BG54 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc3Q8BG54 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms