Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sv2bQ8BG39 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms