Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930022D16RikQ8BG27 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9930022D16RikQ8BG27 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms