Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M10.4Q85ZW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms