Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms