Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atg4cQ811C2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Atg4cQ811C2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg4cQ811C2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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