Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39bQ810L4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms