Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ChfrQ810L3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChfrQ810L3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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