Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amigo1Q80ZD8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Amigo1Q80ZD8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amigo1Q80ZD8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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