Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ClspnQ80YR7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ClspnQ80YR7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClspnQ80YR7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClspnQ80YR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClspnQ80YR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClspnQ80YR7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClspnQ80YR7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms