Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Upk3bQ80YF6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upk3bQ80YF6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms