Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y55

Bsdc1, BSD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bsdc1Q80Y55 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bsdc1Q80Y55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bsdc1Q80Y55 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bsdc1Q80Y55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms