Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrfn4Q80XU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrfn4Q80XU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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