Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pcsk9Q80W65 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Pcsk9Q80W65 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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