Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3cQ80U95 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3cQ80U95 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms