Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgo2Q7TSY8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo2Q7TSY8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms